После ожесточенного боя крейсер Республики, перевозящий груз на скрытую космическую станцию, попал в руки имперцев. В ходе атаки, имперцы узнают местоположение станции, а также ее истинное назначение. Построенная глубоко внутри астероида, станция способна создавать практически бесконечный запас Боевых Дроидов, которые будут подчиняться только сигналу, идущему с главной станции. Империя понимает, что контроль над станцией может изменить ход войны и разрабатывает план по захвату.
Но это будет не так-то просто. Станция находится в руках безумного Джедая, который хочет очистить галактику от Ситхов, а сам комплекс охраняется республиканским флотом. Для успешного захвата станции, Империя посылает небольшую группу самых сильных бойцов на поверхность астероида, чтобы они пробились через армию дроидов и победили сумасшедшего Джедая.
После уверенной победы на Taral V, у Республики есть координаты секретной тюрьмы империи, а также звездные карты, которые помогут в перемещении по опасным туманностям, которые ее окружают. Вооруженные этой информацией, корабли под предводительством Мастера Джедая Oteg`а двинулись в туманность Maelstrom Nebula, чтобы спасти плененного Джедая. Но имперский флот под предводительством безжалостного Гранд Моффа отправился в погорю за кораблями Республики, чтобы отомстить за атаку на планету Империи.
Во время боя между флотами Империи и Республики, небольшая группа пробивается к тюрьме. Теперь они должны работать вместе, чтобы победить элитных солдат Империи, смертоносных боевых дроидов и могущественного Ситха, пытаясь найти и освободить пленного Джедая.
Спрятанная глубоко в опасных регионах космоса имперская тюрьма удерживает легендарного Мастера Джедая. Задолго до возвращения Империи Ситхов из изгнания, Джедай путешествовал по дальним уголкам галактики, чтобы противостоять самому Императору. Но Джедай был побежден и заключен в стазис, пока Император пытался получить информацию из его разума.
На протяжении веков считалось, что этот Джедай мертв, но недавно призрак из Силы рассказал, что давно потерянный Джедай не только жив, но еще и удерживается в плену в туманности Maelstrom Nebula. Вооружившись знаниями, Мастер Джедай Oteg собирает группу самых выдающихся героев Республики и отправляет их на планету Империи Taral V. Там они будут сражаться с легионами солдат Империи и смертоносными существами и украдут имперские координаты, которые укажут местоположение секретной тюрьмы.
В Cademimu творится хаос. Находящийся под следствием Республики губернатор планеты Choranov, обвиняющийся в многочисленных преступлениях против народа, объявил о независимости планеты от Республики и ввел военное положение. Сейчас Choranov вводит личные войска для подавления гражданского восстания. Положение дел стало еще хуже, когда армия губернатора захватила ракетный комплекс Республики, оставим торговый маршрут Celanon Spur незащищенным.
После потери защиты для важного торгового маршрута, Республика собирает отряд для атаки на Cademimu и возврата ракетного комплекса. Но они не одиноки в этом стремлении – Империя увидела в восстании в Cademimu редкую возможность расширения своего влияния. Пока Республика пытается восстановить контроль над своей планетой, Империя отправляет команду для атаки на ракетный комплекс, что приведет к захвату Cademimu и Celanon Spur.
Во время войны одними из самых ценных союзников империи были мандалорцы, общество из воинственных кланов, объединенных своим лидером – Мандалором. После подписания Корусантского договора в рядах мандалорцев начало расти недовольство. В то время, как одни мандалорцы покинули свой клан, чтобы стать охотниками за головами или военными, один клан отвернулся от своего лидера и отправился на ритуальные поиски битвы.
Воинствующий клан Варад захватил мощный военный корабль Республики «Allusis» и начал жестокую компанию против миров Республики и Империи. Клан Варад подрывает стабильность во Внешнем Кольце и должен понести наказание за свои действия. Республика и Империя приводят в действие планы по захвату корабля «Allusis» и приведение приговора в исполнение.
Тысячелетие назад планета Атисс была святилищем ситхов, на которой в храме Водал Кресха (Vodal Kressh) удерживался Лорд Ситхов и величайший алхимик, которого когда-либо видела Империя. Водал был сильным и амбициозным ситхом, но он также был совершенно безумным. Настолько, что после его смерти Император приказал запечатать святилище, а планету объявить запретной зоной. Но сейчас что-то происходит на поверхности планеты.
Республиканская команда археологов во время исследования обнаружила эту планету и начала раскопки на месте древних руин ситхов. Во время изучения руин команда обнаружила нечто мощное, питающееся энергией Темной Стороны, которая исходила от руин. В настоящее время обе стороны собирают отряды для путешествия на планету, чтобы противостоять угрозе и убедиться, что она не выйдет за пределы планеты.
Hammer Station, созданная республиканскими инженерами во время войны, проектировалась как последнее средство против Империи. Это разрушительное супероружие может нанести разрушения планетарного масштаба. Эта боевая станция использует гравитационную пушку, чтобы направить астероиды на планеты и вражеские корабли. После подписания Корусантского договора, станция была списана Республиканской армией и должна была быть уничтожена при столкновении с солнцем.
Сейчас станция оказалась под контролем Advozse Hegemony, которые используют ее пушку для захвата нейтральных миров рядом с оспариваемыми границами. Контроль этой организации над станцией угрожает Империи и Республики, и обе стороны посылают штурмовые команды на Hammer Station, чтобы устранить эту угрозу раз и навсегда.
